Prognostinė mikroRNR raiška, sergant galvos ir kaklo navikais
Recenzentas / Reviewer | |
Komisijos pirmininkas / Committee Chairman | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Darbo tikslas: ištirti ir įvertinti mikroRNR – 27a – 3p bei mikroRNR – 205 raišką sergančiųjų galvos ir kaklo onkologiniais susirgimais sveikame ir navikiniame audinyje ir įvertinti ryšį su ligos eiga. Darbo uždaviniai: 1. Ištirti ir įvertinti mikroRNR – 27a – 3p raiškos pokyčius galvos ir kaklo navikiniame audinyje. 2. Ištirti ir įvertinti mikroRNR – 205 raiškos pokyčius galvos ir kaklo navikiniame audinyje. 3. Nustatyti tirtų mikroRNR ryšį su ligos morfologiniais aspektais ir ligos prognoze. Tyrimo metodika: tyrimo objektais buvo pasirinkti pacientai, sergantys galvos ir kaklo navikais. Biologinė medžiaga iš LSMU MA MF Onkologijos instituto audinių banko atrinkta randomizacijos būdu. Naudojant „AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit“ (Qiagen, Vokietija) buvo išskirtos mikroRNR, kurių raiška vėliau buvo vertinama atlikus realaus laiko PGR reakciją. Gavus duomenis buvo vertinama mikroRNR raiškų pokyčių įtaka klinikiniam ligos pasireiškimui bei prognozei. Statistinė duomenų analizė atlikta naudojant kompiuterinę programą „IBM® SPSS® Statistics 26.0“. Tyrimo rezultatai: viso tyrimo metu buvo atlikta 71 paciento mėginių analizė. Siekiant įvertinti mikroRNR ekspresijos pokyčių ryšį su ligos eiga ir prognoze, buvo apskaičiuotos tirtų mikroRNR raiškų medianos (miR-27a-3p 0,692, miR-205 atitinkamai 0,751). Pagal nustatytą dydį tirti asmenys buvo suskirstyti į didelės ir mažos raiškos grupes. Atlikta statistinė analizė neparodė statistiškai reikšmingo ryšio tarp klinikinių ligos išraiškų bei tyrimo metu tirtų mikroRNR raiškos pokyčių. Abiejų mikroRNR ekspresijos koreliacija su morfologiniais ligos požymiais buvo silpna arba labai silpna. Vis dėlto, pacientams, kuriems buvo nustatyta pažengusi ligos stadija (III – IV), stebėta silpna, tačiau statistiškai reikšminga koreliacija su mikroRNR-27a-3p raiška (r=0,250, p=0,035). Be to, duomenų analizė parodė ryšį tarp padidėjusios miR-205 raiškos ir gerklų vėžio (r=0,242, p=0,042). Apskaičiuota DFS mediana siekė 22 mėnesius, tačiau nei miR-27a-3p, nei miR-205 reikšmingai nekoreliavo su DFS (atitinkamai p=0,539 ir p=0,589). Tyrimo išvados: tirtų mikroRNR medianos nesiekė 1. Tai leidžia daryti išvadą, jog navikiniame GKN audinyje vyravo sumažėjusi minėtų mikroRNR raiška. Nustatytas statistiškai patikimas ryšys tarp padidėjusios miR-27a-3p raiškos ir pažengusios ligos stadijos bei miR-205 raiškos ir gerklų vėžio, tačiau reikšmingos koreliacijos su kitais klinikiniais duomenimis nestebėta.
Aim: to determine microRNA – 27a – 3p and microRNA – 205 expressions in normal and cancerous tissues of head and neck cancer and investigate correlation between expression levels and clinicopathological features. Objectives: 1. To measure and evaluate expression of miR-27a-3p in head and neck cancer. 2. To measure and evaluate expression of miR-205 in head and neck cancer. 3. To determine correlation between miR-27a-3p and miR-205 expression levels and clinicopathological features and prognosis. Methods: in this study we collected tissues of head and neck cancer patients from Tissue Bank of LUHS Institute of Oncology. Biological samples were collected randomly. For purification of total RNA, including miRNA, „AllPrep DNA/RNA/miRNA Universal Kit“ (Qiagen, Germany) was used. Expression of miRNAs was analysed by performing a quantitative real – time polymerase chain reaction. Collected data were compared with clinicopathological features and prognosis. Statistical analysis was performed using „IBM® SPSS® Statistics 26.0“. Results: analysis of 71 patients’ biological samples was performed. A wide range of expression levels was observed. According to the median miR-27a-3p and miR-205 expression values used as a cut-off (0,692 and 0,751 respectively), all patients were classified into high and low expression groups. Statistical analysis did not show significant correlation between clinicopathological features and measured microRNA expressions. Both miR-27a-3p and miR-205 expressions weakly correlated with clinical findings. However, higher expression of miR-27a-3p in head and neck cancer patients significantly correlated with TNM stage (r=0,250, p=0,035). Moreover, we found significant correlation between high expression of miR-205 and laryngeal cancer (r=0,242, p=0,042). The Kaplan-Meier analysis and log-rank test showed that median DFS was 22 months. Unfortunately, neither miR-27a-3p nor miR-205 had significant correlation with disease free survival (p=0,539 and p=0,589 respectively). Conclusions: median expression values of both microRNAs’ were lower than 1. It suggests that low expression levels were observed in head and neck cancer. Significant correlation was measured between higher expression of miR-27a-3p and TNM stage. It also became clear that higher expression of miR-205 correlated with laryngeal cancer. Unfortunately, no significant correlations between mentioned microRNAs’ and other clinicopathological features were observed.