EPDR1 geno polimorfizmų sąsajos su Dupuytreno kontraktūros pasireiškimu

Bakalauro baigiamojo darbo autorius: Emilija Ševluckytė Tema: EPDR1 geno polimorfizmų sąsajos su Dupuytreno kontraktūros pasireiškimu Mokslinis vadovas: Prof. Dr. Alina Smalinskienė; Atlikimo vieta: Lietuvos sveikatos mokslų universitetas, Gamtos mokslų fakultetas, Biologinių sistemų ir genetinių tyrimų institutas Santraukos turinys: Dupuytreno ligai būdingas delno sausgyslės mazgelių susidarymas ir kontraktūra, dėl kurios atsiranda pirštų lenkimo ir rankų funkcijos susilpnėjimas. Genas EPDR1 yra susijęs su Dupuytreno liga, jis veikia fibroblastų kolageno skaidulų gebėjimą susitraukti. Darbo tikslas : Nustatyti geno EPDR1 rs1668357, rs1668347, rs952368 genotipų ir alelių dažnį Dupuytreno kontraktūra (DK) sergantiems ir kontrolinės grupės asmenims bei įvertinti šių genų polimorfizmų reikšmę ligos pasireiškimui. Darbo uždaviniai: Nustatyti geno EPDR1 rs1668357, rs1668347, rs952368 genotipų ir alelių dažnius Dupuytreno kontraktūra DK sergantiems ir kontrolinės grupės asmenims, įvertinti šių polimorfizmų sąsajas su polinkiu sirgti DK ir aplinkos veiksnių poveikį ligos pasireiškimui. Ištirti 118 DK sergantys ir 106 kontrolinės grupės asmenys. Iš periferinio kraujo buvo išskirta genominė DNR druskų nusodinimo ir silikagelio kolonėlių metodais. Genotipavimas atliktas taikant tikro laiko polimerazinės grandinės reakcijos (TL-PGR) metodą, o gauti rezultatai apdoroti statistinės analizės programa „IBM SPSS Statistics 20“. Išvados: Nustatėme geno EPDR1 rs1668357, rs1668347, rs952368 genotipų ir alelių dažnius: DK sergančiųjų grupėje EPDR1 rs1668357 rizikos alelį turintys genotipai (GT ir GG) sudarė mažesnę imties dalį negu turintys laukinio tipo alelį (TT). EPDR1 rs1668347 TG ir GG genotipus ir G alelį statistiškai reikšmingai dažniau turi sergantieji DK. DK sergančiųjų grupėje EPDR1 rs952368 rizikos alelį turintys genotipai (CT ir TT) sudarė mažesnę imties dalį negu turintys laukinio tipo alelį (CC). Įvertinę EPDR1 rs1668347 sąsajas su polinkiu sirgti DK, nustatėme, kad TT genotipas statistiškai reikšmingai mažina, tuo tarpu TG genotipas ir G alelis didina ligos pasireiškimo riziką. Statistiškai reikšmingos įtakos ligos pasireiškimui turi vyriška lytis, rūkymas ir fizinis darbas. Sergantiems asmenims, kurių šeimoje buvo daugiau ligos atvejų, statistiškai reikšmingai padidėja rizika, kad liga pasireikš ankstesniame nei 50 m. amžiuje.

Author of Bachelor thesis: Emilija Ševluckytė Title: Associations of EPDR1 gene polymorphisms with the occurrence of Dupuytren's contracture Supervisor: Prof. Dr. Alina Smalinskienė; Work was performed at: Lithuanian University of Health Sciences; Faculty of Natural Sciences, Institute of Biology Systems and Genetic Research Summary: Dupuytren's disease is characterized by the formation of nodules and contracture of the palmar tendon, which leads to a weakening of finger flexion and hand function. The gene EPDR1 is associated with Dupuytren's disease and affects the ability of fibroblast collagen fibers to contract. The aim of this work is to determine the frequency of genotypes and alleles of EPDR1 gene rs1668357, rs1668347, rs952368 in patients with Dupuytren's contracture (DC) and control group and to evaluate the significance of polymorphisms of these genes in the occurrence of the disease.. The objectives of the study: To determine the frequencies of EPDR1 rs1668357, rs1668347, rs952368 genotypes and alleles in DC patients and the control group, to evaluate the correlations of these polymorphisms with the tendency to develop DC and the impact of environmental factors on the occurrence of the disease. Our study involved 118 DC patients and 106 control group individuals. Genomic DNA was isolated from peripheral blood by salt precipitation and silica gel column methods. Genotyping was performed using the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) method, and the obtained results were processed by the “IBM SPSS Statistics 20” statistical analysis program. Conclusion: We determined the frequencies of EPDR1 rs1668357, rs1668347, rs952368 genotypes and alleles: in the group of DC patients, genotypes with EPDR1 rs1668357 risk allele (GT and GG) made up a smaller part than those with wild-type allele (TT). EPDR1 rs1668347 TG and GG genotypes and G allele are statistically significantly more common in DC patients. In the DC group, EPDR1 rs952368 risk allele-bearing genotypes (CT and TT) accounted for a smaller than those with the wild-type allele (CC). After evaluating the associations of EPDR1 rs1668347 with the tendency to suffer from DC, we found that the TT genotype statistically significantly reduces, while the TG genotype and the G allele increase the risk of disease occurrence. Male sex, smoking and physical work have a statistically significant influence on the occurrence of the disease. Patients with a family history of the disease have a statistically significant increase in the risk that the disease will occur before the age of 50.