Kilpinės izoterminės amplifikacijos (LAMP) metodo pritaikymas atliekant CYP2C19 ir CYP4F2 genotipų nustatymą pacientams sergantiems miokardo infarktu
Rimeikytė, Urtė |
Krukonytė, Urtė | Recenzentas / Reviewer |
Darbo tikslas - atlikti CYP2C192 ir CYP4F2 genetinius tyrimus LAMP metodu kardiologinių ligų pacientų grupėje bei patvirtinti gautus rezultatus tikro laiko PGR metodu. Darbo uždaviniai: 1. Bioinformacinių technologijų pagalba sukurti CYP2C192 ir CYP4F2 genų pradmenis skirtus LAMP metodui atlikti. 2. Ištirti CYP2C19*2 ir CYP4F2 genų variantus LAMP metodu bei palyginti gautus rezultatus su tikro laiko PGR metodu gautais rezultatais. Metodai: LAMP metodas, tikro laiko PGR, elektroforezė agarozės gelyje, DNR skyrimas iš seilių.
Rezultatai ir išvados:
- Naudojantis pradmenų kūrimo programa sukurti CYP2C19*2 ir CYP4F2 pradmenų rinkiniai, kurių pagalba pavyko atlikti LAMP eksperimentines reakcijas.
- Nustatyti pasirinktų CYP2C19*2 ir CYP4F2 genų variantai LAMP metodu atitiko ir buvo patvirtinti tikro laiko PGR metodu gautais rezultatais, tačiau nepavyko išvengti klaidingai teigiamų rezultatų
The aim of the study - to perform genetic studies of CYP2C192 and CYP4F2 by LAMP method in a group of cardiac patients and to validate the obtained results by real-time PCR. Objectives: 1. To develop primers for CYP2C192 and CYP4F2 genes for LAMP method using bioinformatic technologies. 2. To investigate CYP2C19*2 and CYP4F2 gene variants by LAMP and to compare the results with those obtained by real-time PCR. Methods: LAMP method, real-time PCR, agarose gel electrophoresis, DNA isolation from saliva.
Results and conclusions:
- Primer sets for CYP2C19*2 and CYP4F2 have been developed using the primer development program and have been used to perform LAMP experimental reactions.
- The variants identified in the selected CYP2C19*2 and CYP4F2 genes by LAMP were consistent with and validated by real-time PCR, but false positives were not avoided.