Vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrofloros koreliacija
Vasiliauskaitė, Raminta |
Recenzentas / Reviewer | |
Komisijos pirmininkas / Committee Chairman | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Tyrimo tikslas. Įvertinti vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrofloros koreliaciją. Tyrimo uždaviniai. 1. Apžvelgti sveikų vaikų kvėpavimo takų mikrobiotos sudėtį. 2. Įvertinti vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrobiotos pokyčius, sergant cistine fibroze (CF). 3. Įvertinti vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrobiotos pokyčius, sergant ne CF sukelta bronchektaze. 4. Nustatyti viršutinių kvėpavimo takų sekreto tyrimų reikšmę, diagnozuojant apatinių kvėpavimo takų infekcijas, sergant CF. Metodika. Atlikta literatūros apžvalga naudojant Pubmed, Cochrane Library duomenų bazes 2020.10.01 – 2021.02.15. Atsižvelgiant į įtraukimo ir atmetimo kriterijus tyrimo metu apžvelgta 13 mokslinių straipsnių. Rezultatai. Nustatyta, jog sveikų vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikroflora kinta bei priklauso nuo įvairių veiksnių: amžiaus, mitybos, aplinkos sąlygų, antibiotikų naudojimo ir kitų faktorių. Wang ir kiti nustatė, kad sveikų vaikų nosies ir nosiaryklės mikrobiome vyrauja tos pačios bakterijų gentys- Moraxella, Corynebacterium ir Dolosigranulum. Gerklės mikrobiomas (Prevotella, Streptoccocus ir Neisseria spp.) savo sudėtimi reikšmingai skyrėsi nuo pastarųjų anatominių sričių mikrobiomo (p<0,001). Sveikų vaikų plaučių mikrobiome dažniausiai identifikuojamos bakterijų gentys yra Streptococcus ir Haemophilus. Plaučių mikrobiomo sudėtis yra labiau panaši į gerklės nei į nosies ir nosiaryklės mikrobiomą. Vaikų, sergančių CF, viršutiniuose ir apatiniuose kvėpavimo takuose dominavo tipiniai CF patogenai- Pseudomona aeruginosa ir Staphylococcus aureus (p<0,001). Vaikų, sergančių ne CF sukelta bronchektaze, viršutiniuose kvėpavimo takuose dažniausiai buvo nustatoma- Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, o apatiniuose- H. influenzae ir Moraxella catarrhalis. Įvairių autorių duomenimis pacientų, sergančių CF, tik gerklės tepinėlių ištyrimas 16S rRNR genų sekvenavimo metodu patikimai parodė viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrofloros koreliaciją (p<0,001). Tokie patys nosiaryklės tyrimų rezultatai patikimai nekoreliavo su apatinių kvėpavimo takų mikroflora. Išvados. 1. Sveikų vaikų viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikroflora pasižymi rūšine įvairove ir kinta priklausomai nuo amžiaus, mitybos bei kitų veiksnių. 2. Vaikų, sergančių CF, bakterinės rūšinės įvairovės sumažėjimas yra siejamas su tipinių CF sukėlėjų dominavimu. 3. Vaikų, sergančių ne CF sukelta bronchektaze, viršutinių ir apatinių kvėpavimo takų mikrofloros sudėtis reikšmingai nesiskiria nuo sveikų vaikų. 4. Vaikų, sergančių CF, gerklės tepinėliai, ištirti 16S rRNR genų sekvenavimo metodu, yra patikimas neinvazinis apatinių kvėpavimo takų mikrofloros diagnostikos metodas.
Aim of the study. To evaluate correlation between upper and lower airway microflora in pediatric patients.
Objectives. 1. To review the airway microbiota composition of healthy children. 2. To evaluate upper and lower respiratory microbiota in children with cystic fibrosis (CF). 3. To assess upper and lower respiratory microbiota in children with non-CF bronchiectasis. 4. To assess the value of the diagnostic tests of upper airway secretions in diagnosis of lower airway infections in pediatric CF patients. Methods. Literature review was performed by using Pubmed and Cochrane library databases from October 2020 to February 2021. Based on inclusion and exclusion criteria, 13 articles were included in the study. Results. It was identified that upper and lower airway microflora of healthy children is inconsistent and changes over time, depending on many different factors such as age, nutrition, environmental conditions, the use of antibiotics and others. Wang and co-authors detected that microbiomes of anterior nares and nasopharynx share the same, dominant genera of bacterias- Moraxella, Corynebacterium and Dolosigranulum. Throat microbiome (Prevotella, Streptoccocus and Neisseria spp.) significantly differ from anterior nares and nasopharynx microbiomes (p<0,001). Lung microbiome of healthy children mainly harbors Streptococcus and Haemophilus spp. and compared with anterior nares, nasopharynx and throat, was found to be the most similar to throat microbiome. Upper and lower airway of pediatric patients with CF, mainly harbors typical CF pathogens such as Pseudomona aeruginosa, Staphylococcus aureus (p<0,001). Most common bacteria identified in upper airway of non-CF bronchiectasis patients are Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae and the lower airway is mostly harbored by H. influenzae and Moraxella catarrhalis. According to data of various authors, pharyngeal culture investigation by 16S rRNR gene sequencing method showed significant correlation between upper and lower respiratory tract microflora in patients diagnosed with CF (p<0,001). Nasopharyngeal specimens analized by the same method did not reliably reflect the same correlation in CF patients. Conclusions. 1. Upper and lower airway microflora of healthy children contains an abundant and diverse microflora, which depends on age, nutrition and other factors. 2. Bacterial diversity of pediatric patients with CF is closely related with the dominance of typical CF pathogens. 3. The composition of upper and lower airway microflora of pediatric patients with non-CF bronchiectasis, did not differ significantly from healthy controls. 4. Pharyngeal culture investigation by 16S rRNR gene sequencing method is a reliable non-invasive diagnostic method of lower respiratory tract microflora for children diagnosed with CF.