MiR-200c ir miR-141 sąsajos su ligos eiga ir naviko fenotipu pacientams, sergantiems galvos-kaklo navikais
Liugailaitė, Gabija |
Recenzentas / Reviewer | |
Konsultantas / Consultant | |
Komisijos pirmininkas / Committee Chairman | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Šio darbo tikslas buvo įvertinti miR-200c bei miR-141 raiškos pokyčius pacientų, sergančių galvos ir kaklo onkologinėmis ligomis, grupėje ir įvertinti ryšį su ligos eiga ir naviko fenotipu. Darbo tikslui pasiekti buvo iškelti trys uždaviniai: 1. Įvertinti miR-200c ir miR-141 raiškos pokyčius galvos-kaklo navikiniame audinyje; 2. Nustatyti miR-200c ryšį su ligos klinikinėmis charakteristikomis ir ligos prognoze; 3. Nustatyti miR-141 ryšį su ligos klinikinėmis charakteristikomis ir ligos prognoze. Tyrimo objektas – miR-141 ir miR-200c raiškos profiliai galvos-kaklo navikinio audinio biopsinės medžiagos ėminiuose bei jų sąsajos su klinikinėmis savybėmis ir bendru pacientų išgyvenamumu. Metodai. Pacientų (n=113) galvos-kaklo audinių (navikinio ir šalia esančio) ėminiai buvo homogenizuoti ir kolonėlių metodu iš jų buvo išskirta visuminė RNR. Iš visuminės RNR buvo sintetinta kopijinė DNR, kuri toliau buvo pagausinta tikro laiko polimerazės grandininės reakcijos (TL-PGR) metodu. Atlikus TL-PGR buvo apskaičiuoti santykiniai tirtų miRNR raiškos pokyčiai (kartais) navikiniame audinyje, palyginti su šalia esančiu audiniu. Rezultatai. Tyrimo metu buvo atlikta kiekybinė ir kokybinė santykinių miR-141 ir miR-200c raiškos pokyčių pasiskirstymo tarp klinikinių požymių grupių analizė. Buvo patikrintas tirtų miRNR raiškos pokyčių ryšys su klinikinėmis savybėmis ir bendru pacientų išgyvenamumu. Analizės metu buvo gauta statistiškai reikšminga sąsaja tarp miR-200c raiškos sumažėjimo ir 63 m. ar vyresnio paciento amžiaus diagnozės nustatymo metu (ŠS = 2,250; 95 proc. PI (1,033-4,902); p = 0,041). Išvados. Apibendrinant galima teigti, kad galvos-kaklo vėžiu sergančių pacientų audiniuose miR-141 ir miR-200c raiška dažniausiai buvo pakitusi. Tyrimo rezultatai parodė, kad miR-200c raiškos sumažėjimas dažniau buvo nustatomas pacientams, kuriems galvos-kaklo vėžys buvo diagnozuotas vyresniame amžiuje. Dabartiniai rezultatai leidžia manyti, kad tirtos miRNR gali būti svarbios galvos-kaklo vėžio atveju, tačiau sąsajų su klinikinėmis savybėmis ir naviko morfologija patvirtinimui ar atmetimui būtų tikslinga atlikti išsamesnius papildomus tyrimus.
The aim of this study was to evaluate miR-200c and miR-141 expression changes in a group of patients with head and neck cancer and to evaluate its associations with disease course and tumor phenotype. Therefore, three study objectives were defined: 1. To evaluate the changes in the expression of miR-200c and miR-141 in head-neck tumor tissue; 2. To determine the association of miR-200c with the clinical characteristics and the prognosis of the disease; 3. To determine the association of miR-141 with the clinical characteristics of the disease and the prognosis of the disease. The object of the study was the expression profiles of miR-141 and miR-200c in biopsy samples of head-neck tumor tissue and their association with patients’ clinical characteristics and overall survival. Methods. Head-neck tissue samples (tumor and adjacent normal tissues) from the patients (n=113) were homogenized and total RNA was isolated using the spin column method. Copy DNA was synthesized from total RNA, which was further amplified by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The relative changes in the expression of the studied miRNAs were calculated (fold-change) in the tumor tissue compared to the adjacent normal tissue. Results. During the study, a quantitative and qualitative analysis of the distribution of relative changes in miR-141 and miR-200c expression between the groups of different clinical characteristics was performed. Moreover, the associations of changes in the studied miRNA expression with clinical characteristics and overall survival were investigated. During the analysis, a statistically significant association was obtained between the downregulation of miR-200c and the age of 63 years and over at the time of diagnosis (OR = 2,250; 95% CI (1,033-4,902); p = 0,041). Conclusion. In conclusion, it can be stated that the expression of miR-141 and miR-200c was usually altered in the tissues of head-neck cancer patients. The results of the study showed that downregulation of miR-200c was more common in patients of an older age. The present results suggest that the studied miRNAs may be important in head-neck cancer, but to confirm or reject the associations with clinical features and tumor morphology, more detailed additional studies would be appropriate.