Options
T4 RNR ligazės aktyvumo įvertinimas
Matiukievič, Karolina | Thermo Fisher Scientific Baltics |
Povilaitienė, Edita |
Bukelskis, Dominykas | Recenzentas / Reviewer |
Bakalauro baigiamojo darbo autorius: Matiukievič Karolina Tema: RNR ligazių aktyvumo įvertinimas Mokslinis vadovas: Vyr. mokslo darbuotoja Edita Povilaitienė Atlikimo vieta: UAB „Thermo Fisher Scientific Baltics“ mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros centras (MTEPC). Santraukos turinys: Vienas iš parametrų charakterizuojančių fermentą yra jo aktyvumas. Paprastai RNR ligazių aktyvumas tiriamas elektroforetiškai vertinant radioaktyviai žymėto substrato ligavimo efektyvumą arba tiesiogiai/netiesiogiai matuojant ligavimo reakcijos produktų radioaktyvumą. Radioaktyvių izotopų panaudojimas yra vienas iš didžiausių šių metodų trūkumų, be to jie gan ilgai trunka, o, pavyzdžiui, metodas pagrįstas AMP kompleksavimu iš viso neparodo, ar ligazė yra funkciškai aktyvi. Todėl sparčiai vystantis technologijoms ir įrankiams atsiranda galimybė tobulinti esamus bei kurti naujus, greitesnius, saugesnius aplinkai ir žmogui, aktyvumo nustatymo metodus. Šio darbo tikslas – parinkti alternatyvų metodą RNR ligazės aktyvumo įvertinimui. Baigiamajame darbe pademonstruota galimybė fermento aktyvumą vertinti panaudojant molekulinius zondus. Įvertinta temperatūros bei reakcijos komponentų įtaka ligavimo efektyvumui.
Author of the bachelor thesis: Karolina Matiukievič Title: Assessment of RNA ligase activity Supervisor: Staff scientist Edita Povilaitienė Investigation was performed at: "Thermo Fisher Scientific Baltics", UAB - Research & Development center (R&D) Abstract: The enzyme's activity is one of the characteristics that define it. Traditionally, the efficiency of the ligation of a radiolabeled substrate is evaluated electrophoretically or when examining the activity of RNA ligases the radioactivity of the ligation reaction's products is measured directly or indirectly. In addition to taking a long time, these approaches have a number of limitations. For instance, the method based on AMP complexation does not reveal at all whether the ligase is functionally active. As a result, there is a chance to enhance current techniques and develop new ones that are quicker, safer, and more effective in assessing activity. The aim of this work is to choose a different approach to measuring RNA ligase activity. The thesis illustrates how molecular probes can be used to measure RNA ligase activity. The impact of temperature and reaction components on ligation efficiency was studied.