Mitogenu aktyvuojamų proteinkinazių signaliniame kelyje dalyvaujančių genų polimorfizmų sąsajos su gerklų plokščiųjų ląstelių karcinoma

Šio bakalauro baigiamojo darbo tikslas: Nustatyti mitogenu aktyvuojamų proteinkinazių signaliniame kelyje dalyvaujančių genų vieno nukleotido polimorfizmus gerklų plokščiųjų ląstelių karcinoma sergantiems pacientams bei kontrolinės grupės asmenims ir įvertinti jų reikšmę ligos patogenezėje. Darbo uždaviniai: Nustatyti RAF1ir KRAS genų vieno nukleotido polimorfizmų rs1051208 irrs1137188 alelių ir genotipų dažnius pacientams, sergantiems gerklų plokščiųjų ląstelių karcinoma ir kontrolinės grupės asmenims.Taip pat, įvertinti šių genų vieno nukleotido polimorfizmų sąsajas su polinkiu sirgti gerklų plokščiųjų ląstelių karcinoma ir ligos klinikopatologiniais požymiais. Tyrimo metodai ir dalyviai: Ištirti 356 asmenys, kurie buvo padalinti į 2 grupes: sergantieji GPLK (n = 178) ir onkologinėmis ligomis nesergantys asmenys (n = 178). RAF1 rs1051208 ir KRAS rs1137188 genų VNP nustatytas tikro laiko polimerazės grandininės reakcijos metodu. Statistinė duomenų analizė atlikta naudojant„IBM SPSS Statististics 20.0“ kompiuterinę programą. Tyrimo rezultatai:RAF1 rs1051208 ir KRAS rs1137188 genotipų ir alelių pasiskirstymas tiriamųjų ir kontrolinėje grupėse atitinka Hardžio-Veinbergo pusiausvyros dėsnį.RAF1 rs1051208 genotipų dvinarės logistinės regresijosanalizės rezultatai parodė, jog AG genotipas didina riziką sirgti gerklų vėžiu. RAF1 rs1051208 polimorfizmo genotipų (p =0,004) ir alelių (p = 0,001) pasiskirstymas lyginant išplitimą į sritinius kaklo limfmazgius yra statistiškai reikšmingas. RAF1 rs1051208 ir KRAS rs1137188 polimorfizmų genotipų (p = 0,047; p=0,048) ir alelių (p = 0,028; p=0,038) dažnių pasiskirstymas pagal auglio diferenciacijos laipsnį yra statistisškai reikšmingi.Išvados:1) Kontrolineje grupėje RAF1 geno rs1051208 polimorfizmo laukinio tipo homozigotinis GG genotipas buvo statistiškai reikšmingai didesnis, lyginant su gerklų vėžiu sergančių asmenų grupe (42,7 proc. vs. 26,97proc.; p=0,004). 2) KRAS geno vieno nukleotido polimorfizmo rs1137188 genotipų ir alelių dažniai tarp sergančiųjų gerklų plokščių ląstelių karcinoma ir kontrolinės grupės statistiškai reikšmingai nesiskyrė (p > 0,05). 3) RAF1 geno polimorfizmas rs1051208 didina riziką gerklų vėžiu: AG genotipą turintiems asmenims polinkis sirgti gerklų vėžiu 1,710 karto didesnis, nei turintiems AA genotipą (p=0,046) ir 2,016 katro didesnis lyginant su GG genotipą turinčiais (p=0,002). 4) RAF1 ir KRAS genų VNP susiję su gerklų vėžio klinikopatologiniais rodikliais.

The aim of the study: To identify mitogen-activated protein kinases, single nucleotide polymorphisms (SNP) of genes involved in the signaling pathway of mitogen-activated protein kinases in patients with laryngeal squamous cell carcinoma and in the control group and to assess their significance in the pathogenesis of the disease.Objectives: To identify polymorphisms of mitogen-activated protein kinases in single nucleotide polymorphisms of genes involved in the signaling pathway of mitogen-activated protein kinases in patients with laryngeal squamous cell carcinoma and to assess their significance in the pathogenesis of the disease. Tasks of the work: To determine the frequencies of the RAF1 and KRAS genes of single nucleotide polymorphisms rs1051208 and rs1137188 alleles and genotypes in patients with laryngeal squamous cell carcinoma and individuals in the control group. Also, to evaluate the links between the polymorphisms of a single nucleotide of these genes with the tendency to suffer from laryngeal squamous cell carcinoma and clinical signs of the disease. Material and methods of the study: A total of 356 laryngeal cancer patients and 178 healthy controls were enrolled. RAF1 rs1051208 and KRAS rs1137188 genotype testing was performed using real-time polymerase chain reaction. Statistical analysis was done using IBM SPSS Statistics 20.0 software. Results: The distribution of the genotypes and alleles of the RAF1 rs1051208 and KRAS rs1137188 in the test and control groups is consistent with the Hardy-Veinberg law of equilibrium. The results of the binary logistic regression analysis of the genotypes RAF1 rs1051208 showed that the AG genotype increases the risk of developing laryngeal cancer. The division of the genotypes of RAF1 rs1051208 polymorphism (p =0.004) and alleles (p = 0.001) by comparing the spread to the lymph nodes of the neck is statistically significant. According to the degree of tumor differentiation the frequency distribution of the RAF1 rs1051208 and KRAS rs1137188 polymorphisms (p = 0.047; p=0.048) and alleles (p = 0.028; p=0.038) according to the degree of tumor differentiation is statistically significant. Conclusions: 1)In the control group, the homozygous GG genotype of the wild type of the RAF1 gene rs1051208 was statistically significantly higher compared to the group of individuals with laryngeal cancer (42.7% vs. 26.97%; p=0.004). 2) The incidences of polymorphism rs1137188 of the KRAS gene single nucleotide rs1137188 and alleles did not differ statistically significantly between those with laryngeal squamous cell carcinoma and the control group (p > 0.05). 3) Polymorphism of the RAF1 gene rs1051208 increases the risk of laryngeal cancer: individuals with genotype AG have a 1.710 times higher propensity to have laryngeal cancer than those with genotype AA (p=0.046) and 2.016 katro higher than those with the GG genotype (p=0.002). 4) The SNP of the RAF1 and KRAS genes is associated with clinical pathology indicators of laryngeal cancer.