Ilgos nekoduojančios RNR molekulės HOTAIR polimorfizmų įtaka krūties vėžio klinikinėms ir morfologinėms savybėms bei krūties vėžiu sergančių pacienčių ligos eigai
Konsultantas / Consultant | |
Recenzentas / Reviewer |
Tyrimo tikslas. Ištirti ilgos nekoduojančios RNR molekulės HOTAIR polimorfizmų įtaką krūties vėžio klinikinėms ir morfologinėms savybėms bei krūties vėžiu sergančių pacienčių ligos eigai. Tyrimo uždaviniai. 1. Ištirti ilgos nekoduojančios RNR molekulės HOTAIR polimorfizmų (rs920778, rs7958904, rs12826786) genotipų ir alelių dažnius pacienčių, sergančių krūties vėžiu, grupėje.2. Įvertinti šių polimorfizmų sąsajas su naviko klinikinėmis ir morfologinėmis savybėmis. 3. Nustatyti šių polimorfizmų sąsają su krūties vėžiu sergančių pacienčių ligos eiga. Tyrimo dalyviai. Į tyrimą įtrauktos 188 krūties vėžiu sergančios pacientės. Tyrimo metodai. HOTAIR polimorfizmai rs920778, rs7958904, rs12826786 buvo tirti naudojant tikro laiko polimerazės grandininės reakcijos metodą (TL-PGR). Tyrimo atlikimui buvo naudoti iš tiriamų pacienčių kraujo mėginių išskirti DNR mėginiai. Sąsajų tarp HOTAIR geno polimorfizmų ir naviko klinikinių ir morfologinių savybių bei pacienčių ligos eigos įvertinimas atliktas naudojant „IBM SPSS Statistics“ programos paketą. Tyrimo rezultatai. Nustatytas HOTAIR polimorfizmo rs920778 genotipų pasiskirstymas: AA – 42,0 %, GG – 14,4 %, AG – 43,6 %, alelių pasiskirstymas: A alelis – 63,8 %, G alelis – 36,2 % Polimorfizmo rs7958904 genotipų pasiskirstymas: GG – 43,1 %, CC – 12,8 %, GC – 44,1 %, alelių: G alelis – 65,2 %, C alelis – 34,8 % Polimorfizmo rs12826786 genotipų pasiskirstymas: CC – 45,2 %, TT – 12,2 %, CT – 42,6 %, alelių: C alelis – 66,5 %, T alelis – 33,5 %. Atlikta Chi kvadrato testo bei vienveiksnės logistinės regresijos analizė parodė statistiškai reikšmingą ryšį tarp rs920778 polimorfizmo G alelio ir limfmazgių pažaidos, rs7958904 polimorfizmo C alelio ir limfmazgių pažaidos, rs12826786 polimorfizmo T alelio ir naviko dydžio bei limfmazgių pažaidos. Visgi, daugiaveiksnė logistinės regresijos analizė parodė, kad šios sąsajos praranda reikšmingumą, kai į analizę yra įtraukiami papildomi veiksniai, tokie kaip amžius, receptorių būklė, naviko dydis bei diferenciacijos laipsnis. Reikšmingų sąsajų tarp HOTAIR polimorfizmų ir krūties vėžiu sergančių pacienčių ligos eigos nenustatyta. Išvados. 1. HOTAIR rs920778 polimorfizmo AG genotipas tarp tiriamųjų buvo dažniausias, GG rečiausias, A alelis pasireiškė dažniau už G; rs7958904 polimorfizmo GC genotipas buvo dažniausias, CC rečiausias, G alelis nustatytas dažniau už C; rs12826786 polimorfizmo CC genotipas buvo dažniausias, TT – rečiausias, C alelis nustatytas dažniau už T. 2. Statistiškai reikšmingų sąsajų tarp HOTAIR polimorfizmų rs920778, rs7958904, bei rs12826786 ir krūties vėžio klinikinių ir morfologinių savybių nenustatyta. 3. Analizuoti HOTAIR polimorfizmai nebuvo statistiškai reikšmingai susiję su krūties vėžiu sergančių pacienčių ligos eiga.
Aim. To investigate the influence of long non-coding RNA HOTAIR single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on clinical and morphological features, and prognosis in patients with breast cancer. Objectives. 1. To investigate the genotype and allele frequencies of long non-coding RNA HOTAIR SNPs (rs920778, rs7958904, rs12826786) in a cohort of breast cancer patients. 2. To evaluate the relationship between these SNPs and the clinical and morphological features of breast cancer. 3. To evaluate the influence of these SNPs on the prognosis of patients with breast cancer. Participants. 188 breast cancer patients were enrolled in the study. Methods. HOTAIR SNPs (rs920778, rs7958904, and rs12826786) were analysed using real-time PCR (qPCR) with DNA extracted from whole blood samples. Results were analysed using „IBM SPSS Statistics“ software. Results. The following HOTAIR SNP rs920778 genotype frequencies were recorded: AA – 42,0 %, GG – 14,4 %, AG – 43,6 %, allele frequencies were the following: A allele – 63,8 %, G allele – 36,2 %. rs7958904 genotype frequencies: GG – 43,1 %, CC – 12,8 %, GC – 44,1 %, allele frequencies: G allele – 65,2 %, C allele – 34,8 %. rs12826786 genotype frequencies: CC – 45,2 %, TT – 12,2 %, CT – 42,6 %, allele frequencies: C allele – 66,5 %, T allele – 33,5 %. Chi square test and univariate binary logistic regression showed a statistically significant relationship between rs920778 G allele, rs7958904 C allele, rs12826786 T allele and regional lymph node involvement, as well as a statistically significant relationship between rs12826786 T allele and primary tumour size. However, multivariate binary logistic regression results showed these relationships to be insignificant after adjusting for other factors, such as age at diagnosis, receptor status, primary tumour size, and primary tumour grade. No significant association between HOTAIR SNPs and patient prognosis was recorded. Conclusions. 1. For HOTAIR rs920778, AG and GG genotypes were most and least frequent, respectively, with A allele showing higher frequency than G. For rs7958904, GC and CC genotypes were most and least frequent, respectively, with G allele showing higher frequency than C. For rs12826786, the CC and TT genotypes were most and least frequent, respectively, with C allele showing higher frequency than T. 2. No statistically significant association between HOTAIR SNPs rs920778, rs7958904, and rs12826786 and clinical and morphological features of breast cancer was recorded. 3. The SNPs in question did not significantly influence prognosis in patients with breast cancer.