COX-2 geno polimorfizmų, dalyvaujančių burnos dugno ir gerklų vėžio patogenezėje, tyrimas

Bakalauro baigiamojo darbo autorius: Venckutė L. Tema: COX-2 geno polimorfizmų, dalyvaujančių burnos dugno ir gerklų vėžio patogenezėje, tyrimas Mokslinis vadovas: Prof. dr. A. Smalinskienė Atlikimo vieta: Lietuvos sveikatos mokslų universitetas, Veterinarijos akademija, Gyvulininkystės fakultetas, Biologinių sistemų ir genetinių tyrimų institutas Santraukos turinys: COX-2 fermentas paverčia arachidono rūgštį į prostanoidus. Šio fermento raiška retai aptinkama sveikame organizme, sintezę inicijuoja citokinai, augimo faktoriai, naviko skatintojai, mitogenai. Padidėjusi COX-2 raiška atlieka svarbų vaidmenį naviko iniciacijoje, augime, metastazavime, nes dalyvauja procesuose, kurie skatina kancerogenezę. COX-2 vieno nukleotido polimorfizmai (VNP) daro įtaką geno raiškai, fermentiniam aktyvumui ir yra susiję su uždegiminiu atsaku ir individualiu jautrumu vėžiui. Darbo tikslas – nustatyti COX-2 geno rs689466 ir rs5275 genotipų ir alelių dažnį burnos dugno ir gerklų vėžiu sergantiems bei kontrolinės grupės asmenims ir įvertinti šio geno polimorfizmų reikšmę burnos dugno ir gerklų plokščiųjų ląstelių karcinomos (PLK) patogenezėje. Pagrindiniai darbo uždaviniai – nustatyti COX-2 geno rs689466 ir rs5275 genotipų ir alelių dažnį burnos ir gerklų vėžiu sergančių pacientams ir kontrolinės grupės asmenims, įvertinti šio geno polimorfizmų reikšmę polinkiui sirgti burnos dugno ir gerklų vėžiu bei sąsajas su klinikopatologiniais ligos rodikliais. Ištirti 63 burnos, 332 gerklų vėžiu sergantys pacientai bei 372 sveiki, kontrolinės grupės asmenys. Iš periferinio kraujo buvo išskirta genominė DNR druskų nusodinimo ir silikagelio kolonėliu metodais. Genotipavimas atliktas taikant tikro laiko polimerazinės grandinės (TL-PGR) metodą, o gauti rezultatai apdoroti statistinės analizės programa „IBM SPSS Statistics 28“. Nustatyti COX-2 geno polimorfimų genotipų ir alelių dažniai burnos ir gerklų vėžiu sergantiems pacientams, tačiau atlikus statistinę analizę, jie statistiškai reikšmingai nesiskyrė nuo kontrolinės grupės. Atlikus dvinarę logistinę regresiją nustatyta, kad VNP rs5275 GG genotipas ir G alelis didina riziką sirgti burnos dugno vėžiu. Sąsajų tarp tirtų VNP ir klinikopatologinių onkologinių ligų rodiklių nenustatyta. Tyrimo išvados: Nustatėmė, kad burnos dugno ir gerklų vėžiu sergančių pacientų COX-2 rs689466 ir rs5275 genotipų ir alelių dažniai statistiškai reikšmingai nesiskyrė nuo kontrolinės grupės. Nustatėme, kad kad turintiems COX-2 rs5275 homozigotinį GG genotipą rizika sirgti burnos vėžiu didėja 2,068 (p=0,046) karto, o turintiems mutantinį G alelį 1,464 (p=0,049) karto. Statistiškai reikšmingų sąsajų tarp VNP rs689466 ir polinkio sirgti tirtomis onkologinėmis ligomis nenustatėme. Analizuojant ligos klinikopatologinius rodiklius, nenustatėme statistiškai reikšmingų sąsajų su tirtais VNP.

Author of bachelor thesis: Venckutė L. Title: Research of the COX-2 Gene Polymorphisms Involved in The Pathogenesis of Oral And Laryngeal Cancer Supervisor: Prof., PhD A. Smalinskienė Work was performmed at: Lithuanian University of Health Sciences; Veterinary Academy; Faculty of Animal Husbandry Technology, Institute of Biology Systems and Genetic Research Summary: COX-2 is the rate-limiting enzyme for the conversion of arachidonic acid to prostanoids. COX- 2 is rarely expressed in normal tissues, but it is rapidly induced by cytokines, growth factors, tumor promoters and mitogens. Overexpression of the COX-2 plays an important role in initiation, growth and spread of tumors by interfering with different biological processes which promote carcinogenesis. COX- 2 gene polymorphisms affect the expression levels and enzymatic activity of COX-2 and therefore are intimately linked to inflammatory response and individual variations in the susceptibility to cancer. The aim of this study is to determine the frequency of COX-2 gene polymorphisms rs689466, rs5275 genotypes and alleles in oral and laryngeal cancer as well as control groups and evaluate the polymorphisms influence in the pathogenesis of these oncological diseases. The objectives of the study: determinate frequency of COX-2 gene polymorphisms rs5275, rs689466 genotypes and alleles in the oral and larynx cancer patients. Determine the associations of polymorphisms rs5275, rs689466 of COX-2 gene with the tendency to oral and laryngeal cancer and clinicopathological indicators. Our study involved 63 patients with oral cancer, 332 patients with larynx cancer and 372 healthy persons from control group. DNA was extracted from peripheral blood using DNA salting-out method and silica gel polymer containing tubes. Genotyping was carried out using real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) method, statistical analysis was performed with IMB SPSS Statistic 28.0. Frequency of genotypes and alleles of COX-2 gene polymorphisms in oral and larynx cancer patients were determined, but they were not statistically significantly different from the control group. Binary logistic regression revealed that polymorphism rs5275 GG genotype and G allele increase the risk of oral cancer. No statistical significant associations were absorved between studied polymorphisms and clinicopathological indicators. Conclusion: Frequency of COX-2 rs5275 and rs689466 genotypes and alleles in laryngeal cancer, oral cancer patients and control groups were determined. We found no statistically significant differences between the genotypes and allele frequencies of the study groups. We found that individuals with COX-2 rs5275 homozygous GG genotype had a 2,068 increased risk for oral cancer (p=0,046). rs5275 G allele were associated with a 1,464 increased risk for oral cancer (p=0,046). No statistical significant associations were absorved with rs689466 and researched oncological diseases. No statistical significant associations were found between rs689466, rs5275 and clinicopathological indicators.