Hsa-mir-328-3p ir PAX6 baltymo raiškos sąsajos su akių refrakcijos sutrikimais

Bakalauro baigiamojo darbo autorius: Dovilė Juocevičiūtė Tema: Hsa-mir-328-3p ir PAX6 baltymo raiškos sąsajos su akių refrakcijos sutrikimais Mokslinis vadovas: dr. Edita Kuncevičienė Atlikimo vieta: Lietuvos sveikatos mokslų universitetas (LSMU), Biologinių sistemų ir genetinių tyrimų institutas, Dr. K. Janušausko genetikos laboratorija ir LSMU, Akių ligų klinika, Neuromokslų institutas, Oftalmologijos laboratorija Santraukos turinys: Tyrimo tikslas – įvertinti hsa-mir-328-3p ir PAX6 baltymo raiškos sąsajas su refrakcijos sutrikimais. Darbo uždaviniai:

1. Nustatyti hsa-miR-328-3p raišką trumparegystės, toliaregystės ir kontrolinės grupės tiriamiesiems.
2. Nustatyti PAX6 baltymo raišką toliaregystės, trumparegystės ir kontrolinės grupės tiriamiesiems.
3. Įvertinti hsa-miR-328-3p ir PAX6 baltymo sąsajų reikšmingumą akių refrakcijos pasireiškimui. Tyrimo medžiaga ir metodai: Tyrime dalyvavo 69 trumparegiai, 32 toliaregiai ir 43 refrakcijos sutrikimų neturintys asmenys. PAX6 baltymo koncentracija kraujo serume buvo nustatyta ELISA metodu. MiR-328 raiška buvo nustatyta naudojant tikro laiko polimerazės grandininę reakciją (TL-PGR). Statistinė analizė atlikta naudojant statistinę „IBM SPSS Statistics 27“ programą. Tyrimo rezultatai: Atlikus koreliacijos skaičiavimus, trumparegystės grupėje gauta silpna neigiama koreliacija tarp ΔΔCt miR-328 ir PAX6 – mažėjant ΔΔCt miR-328 didėja PAX6 baltymo koncentracija, o toliaregystės grupėje gauta silpna teigiama koreliacija tarp ΔΔCt miR-328 ir PAX6, tačiau abiejų grupių atveju rezultatai nebuvo statistiškai reikšmingi. MiR-328 kaip galimo biožymens trumparegystei nustatyti AUC = 0,556, o PAX6 baltymo AUC = 0,602. MiR-328 kaip galimo biožymens toliaregystei nustatyti AUC = 0,514, o PAX6 AUC = 0,513. Tyrimo išvados:
4. ΔΔCt miR-328 ir PAX6 baltymo raiška statistiškai reikšmingai nesiskiria tarp refrakcijos sutrikimų grupių ir kontrolinės grupės.
5. Atlikus koreliacijos apskaičiavimus nebuvo rastas statistiškai reikšmingas ryšys tarp ΔΔCt miR-328 ir PAX6 baltymo raiškos refrakcijos sutrikimų grupėse ir kontrolinėje grupėje.
6. Remiantis ROC kreivių AUC plotais, ΔΔCt miR-328 ir PAX6 baltymas kaip galimas prognostinis biožymuo nėra tinkamas trumparegystei ar toliaregystei prognozuoti.

Author of bachelor thesis: Dovilė Juocevičiūtė Title: Associations of Hsa-mir-328-3p and PAX6 Protein Expression with Ocular Refractive

Supervisor: PhD. Edita Kuncevičienė Work was performed at: Lithuanian University of Health Sciences (LUHS), Institute of

Biology Systems and Genetic Research, Dr. K. Janušauskas’ Laboratory of Genetics and LUHS, Eye Clinic, Neuroscience Institute, Laboratory of Ophthalmology Summary: Aim of the study – to assess the association of hsa-mir-328-3p and PAX6 protein expression with refractive errors. Objectives:

1. To determine the expression of hsa-miR-328-3p in myopic, hyperopic and control subjects.
2. To determine the expression of PAX6 protein in myopic, hyperopic and control subjects.
3. To assess the significance of the association between hsa-miR-328-3p and PAX6 protein on the occurrence of ocular refraction. Materials and methods: 69 myopes, 32 hyperopes and 43 non-refractive subjects participated in the study. Serum PAX6 protein levels were determined by ELISA. The expression of miR-328 was determined by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). Statistical analysis was performed using “IBM SPSS Statistics 27” software. Results: In the myopia group there was a weak negative correlation between ΔΔCt miR-328 and PAX6 – as PAX6 increases ΔΔCt miR-328 decreases, and in the hyperopia group, there was a weak positive correlation between ΔΔCt miR-328 and PAX6, but the results were statistically insignificant for both groups. The miR-328 as a possible biomarker for myopia had an AUC = 0.556, while the PAX6 protein had an AUC = 0.602. MiR-328 as a potential biomarker for farsightedness has an AUC = 0.514 and PAX6 an AUC = 0.513. Conclusion:
4. ΔΔCt miR-328 and PAX6 protein expression are not statistically significantly different between the refractive error groups and the control group.
5. The correlation calculations showed no statistically significant association between ΔΔCt miR-328 and PAX6 protein expression in the refractive error groups and the control group.
6. Based on the AUC plots of the ROC curves, ΔΔCt miR-328 and PAX6 protein as a potential prognostic biomarker are not suitable for the prediction of myopia or hyperopia.