Analysis of Escherichia coli and Clostridium perfringens in small intestines of suckling piglets
SCHIBALSKI, Charles Dominik |
Recenzentas / Reviewer | |
Recenzentas / Reviewer | |
Komisijos sekretorius / Committee Secretary | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
The objective of this research study is to investigate Escherichia coli and Clostridium perfringens of sucking piglets from small intestines. This master thesis work was performed in the Department of Pathobiology of the Lithuanian University of Health Sciences (LUHS) in Lithuania / Kaunas in collaboration with the branch of Epidemiology in Bakum / Germany of the Institution of the Veterinary University Hannover. 156 diseased suckling piglets from four northern german farms of different sizes were necropsied and microbiologically examined for the presence of Escherichia coli and Clostridium perfringens, following the detailed determination and analysis of the serotypes and virulence factors of E. coli and types and toxins of C. perfringens. Subsequently the isolated pathogens were checked for their antimicrobial resistance. The obtained data and available information about the farms was used to determine possible differences regarding the farm size and possible occurring issues with suckling piglets. It was detected that enterotoxigenic Escherichia coli-F4 (ETEC-F4) made up the majority of detected serotypes and virulence factors of Escherichia coli with 14.29%. In the Clostridium perfringens isolates, type A including β2 toxin represented 94.2% of the types and toxins found. Statistically no significant difference between the infection forms or the infectious agent types and specifications could be detected. The isolated Escherichia coli showed to be mostly susceptible to the antibiotics amoxicillin / clavulanic acid, cefquinom, colistin, gentamicin and neomycin, whereas the highest resistance was found to be with erythromycin, penicillin G and clindamycin. Clostridium perfringens was found to be mostly susceptible to amoxicillin / clavulanic acid, ampicillin, cefquinom and florfenicol, whereas the highest resistance was found to be with colistin and gentamicin.
Šio tyrimo tikslas buvo ištirti Escherichia coli ir Clostridium perfringens bakterijas, išskirtas iš paršelių žinduklių plonųjų žarnų. Šis magistrinis darbas buvo atliktas Lietuvos Sveikatos Mokslų Universiteto (LSMU) Patologijos Centre (Kaunas, Lietuva), bendradarbiaujant su Hanoverio Veterinarinės Medicinos Universiteto (Hanoveris, Vokietija) Epidemiologijos instituto skyriumi Bakume (Bakumas, Vokietija).
Tirti 156 paršelių žinduklių lavonai iš 4 šiaurinėje Vokietijos dalyje įsikūrusių skirtingo dydžio kiaulių ūkių, norinti nustatyti Escherichia coli ir Clostridium perfringens paplitimą; atlikta išsami analizė išskiriant abiejų bakterijų serotipus bei E. coli virulentiškumo veiksnius bei ir C. perfringens toksinus. Toliau buvo nustatytas išskirtų patogeninių bakterijų atsparumas antimikrobinėms medžiagoms. Gauti mikrobiologinio tyrimo duomenys bei informacija apie ūkius buvo naudojam, norint įvertinti tryšį tkiaulių ūkio dydžio bei juose pasireiškiančių paršelių žinduklių ligų.
Tyrimo metu buvo nustatyta, kad enterotoksigeninės Escherichia coli padermės F4 (ETEC-F4) sudarė 14,29 proc. višskirtų E. coli serotipų ir virulentiškumo faktorių. Nustatytas Clostridium perfringens, A tipas, turintis β2 toksiną, sudarė 94,2 proc.. Nebuvo nustatyta jokių statistiškai reikšmingų skirtumų tarp infekcijų formų ar infekcinių sukelėjų tipų bei infekcinių agentų ypatybių. Išskirtos Escherichia coli padermės buvo jautriausios antimikrobinėms medžiagoms: amoksiciklinui su klavulano rūgštimi, cefkvinomui, kolistinui, gentamicinui bei neomicinui; tuo tarpu E. coli atsparumas buvo nustatytas eritromicinui, penicillinui G ir klindamicinui. Clostridium perfringens bakterijos pasižymėjo didžiausiu jautrumu amoksiciklinui su klavulano rūgštimi, ampicillinui, cekvinomui ir florfenikoliui, o didžiausias atsparumas buvo nustatytas kolistinui bei gentamicinui.