VEGF-A geno variantų sąsajų su plokščialąsteliniu gerklų vėžiu tyrimas
Recenzentas / Reviewer | |
Konsultantas / Consultant |
Magistro baigiamojo darbo autorius: Ineta Stankevičiūtė Tema: VEGF-A geno variantų sąsajų su plokščialąsteliniu gerklų vėžiu tyrimas. Mokslinis vadovas: prof. habil. dr. Virgilijus Ulozas Atlikimo vieta: Lietuvos sveikatos mokslų universitetas, Ausų, nosies ir gerklės ligų klinika. Tyrimo tikslas: Įvertinti VEGF-A geno variantų sąsajas su plokščialąstelinio gerklų vėžio išsivystymo rizika, gerklų vėžiu sergančių pacientų naviko fenotipu bei pacientų išgyvenamumu. Tyrimo uždaviniai:
- Ištirti VEGF-A geno vieno nukleotido polimorfizmų rs699947 ir rs1005230 alelių ir genotipų dažnius kontrolinėje ir pacientų, sergančių gerklų vėžiu, grupėse;
- Įvertinti šių polimorfizmų sąsajas su gerklų vėžiu sergančių pacientų naviko savybėmis
- Išanalizuoti tiriamų polimorfizmų sąsajas su pacientų, sergančių gerklų vėžiu, bendru išgyvenamumu. Tyrimo metodai: Atliktas dviejų VEGF-A geno polimorfizmų (rs699947 ir rs1005230) genotipavimas tikro laiko polimerazės grandininės reakcijos (TL-PGR) metodu. Išanalizuotas polimorfizmų alelių ir genotipų pasiskirstymas kontrolinėje ir pacientų, sergančių gerklų vėžiu, grupėse bei sąsajos su gerklų vėžiu sergančių pacientų naviko fenotipu ir pacientų išgyvenamumu. Statistiniai analizei naudota IBM SPSS Statistics 29.0.0.0 programos versija. Tyrimo dalyviai: Retrospektyviniame tyrime įtraukti 199 kontrolinei grupei priskirti asmenys (vyrai) ir 199 gerklų vėžiu sergantys pacientai (vyrai), kurių mėginiai ir nuasmeninti duomenys yra saugomi Lietuvos sveikatos mokslų universiteto Onkologijos institute. Tyrimo rezultatai: Atlikus VEGF-A geno polimorfizmų rs699947 ir rs1005230 genotipavimą nustatytas vienodas jų dažnis kiekvienoje grupėje. Polimorfizmų genotipų dažnių pasiskirstymas atitiko Hardžio ir Veinbergo dėsnį. Atlikus statistinę analizę nustatyta, kad rs699947 ir rs1005230 genotipų pasiskirstymas tarp sergančių ir kontrolinės grupės asmenų statistiškai reikšmingai nesiskyrė. Tyrimo rezultatai parodė statistiškai reikšmingą rs699947 ir rs1005230 polimorfizmų CC genotipų sąsają su mažesniais blogai diferencijuojamo–nediferencijuojamo (G3-G4) naviko tipo galimybių šansais. Kitų reikšmingų sąsajų tarp polimorfizmų ir naviko savybių, pacientų išgyvenamumo bei gerklų vėžio pasireiškimo rizikos nenustatyta. Išvados:
- Ištirti VEGF-A geno vieno nukleotido polimorfizmų rs699947 ir rs1005230 alelių ir genotipų dažniai kontrolinėje ir pacientų, sergančių gerklų vėžiu, grupėse. Tarp polimorfizmų ir gerklų vėžio pasireiškimo statistiškai reikšmingas ryšys nenustatytas.
- Nustatyta, kad asmenims su VEGF-A rs699947 CC ir rs1005230 CC genotipais reikšmingai rečiau nustatytas blogai diferencijuojamas–nediferencijuojamas (G3-G4) gerklų navikas.
- Statistiškai reikšmingų sąsajų tarp rs699947 ir rs1005230 bei pacientų, sergančių gerklų vėžiu, bendro išgyvenamumo, nerasta.
Author of master thesis: Ineta Stankevičiūtė Title: Associations of VEGF-A Gene Variants with Laryngeal Squamous Cell Cancer Research Scientific supervisor: prof. habil. dr. Virgilijus Ulozas Work was performed at: Lithuanian University of Health Sciences; Ear, Nose and Throat Clinic. Aim: To assess the associations of VEGF-A gene variants with the risk of developing squamous cell laryngeal cancer, the tumor phenotype of laryngeal cancer patients, and patient survival. Tasks:
- To investigate the frequencies of alleles and genotypes of single nucleotide polymorphisms rs699947 and rs1005230 of the VEGF-A gene in the control group and the group of patients with laryngeal cancer;
- To evaluate the associations of these polymorphisms with the tumor characteristics of patients with laryngeal cancer;
- To analyze the associations of the studied polymorphisms with the overall survival of patients with laryngeal cancer. Methods: Genotyping of two VEGF-A gene polymorphisms (rs699947 and rs1005230) was performed by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The distribution of alleles and genotypes of polymorphisms in the control group and in the group of patients with laryngeal cancer and the relationship with the tumor phenotype of laryngeal cancer patients and patient survival were analyzed. IBM SPSS Statistics version 29.0.0.0 was used for statistical analysis. Participants: The retrospective study enrolled 199 people of control group (men) and 199 patients with laryngeal cancer (men), whose blood samples and depersonalized data are stored in the biobank of the Oncology Institute of the Lithuanian University of Health Sciences. Results: Genotyping of the VEGF-A gene polymorphisms rs699947 and rs1005230 revealed the same frequency in each group. The frequency distribution of polymorphism genotypes corresponded to Hardy-Weinberg equilibrium. Data analysis showed that the distribution of rs699947 and rs1005230 genotypes was not statistically significantly different between patients and control group. The results of the study showed a statistically significant association of rs699947 and rs1005230 polymorphisms CC genotypes with lower odds of poorly differentiated-undifferentiated (G3-G4) tumour type. No other significant associations between polymorphisms and tumour characteristics, patient survival and the risk of laryngeal cancer were found. Conclusions:
- Frequencies of alleles and genotypes of VEGF-A gene single nucleotide polymorphisms rs699947 and rs1005230 were investigated in control group and group of patients with laryngeal cancer. No statistically significant association was found between polymorphisms and the occurrence of laryngeal cancer.
- It was determined that individuals with VEGF-A rs699947 CC and rs1005230 CC genotypes had a significantly lower incidence of poorly differentiated-undifferentiated (G3-G4) laryngeal tumor.
- No statistically significant associations were found between rs699947 and rs1005230 and overall survival in laryngeal cancer patients.