Pseudomonas aeruginosa atsparumo antibiotikams dinamika priklausomai nuo infekcijos židinio ir klinikinio skyriaus.

Magistro darbo autorius: Greta Mikučionytė

Magistro darbo pavadinimas: Pseudomonas aeruginosa atsparumo antibiotikams dinamika priklausomai nuo infekcijos židinio ir klinikinio skyriaus.

Darbo tikslas: Įvertinti klinikinių P. aeruginosa padermių atsparumo antibiotikams ypatumus, 2013 m. – 2015 m. ir 2020 m. – 2022 m.

Darbo uždaviniai:

1. Įvertinti P. aeruginosa išskyrimo dažnio dinamiką priklausomai nuo infekcijos židinio ir klinikinio skyriaus, 2013 m. – 2015m. ir 2020 m. – 2022m.
2. Įvertinti P. aeruginosa atsparumo antibiotikams dinamiką Intensyvios terapijos (ITS), Chirurgijos (CHS), Terapiniuose skyriuose (TS), 2013 m. – 2015 m. ir 2020 m. – 2022 m.
3. Įvertinti P. aeruginosa atsparumą antibiotikams priklausoma nuo infekcijos židinio, 2013 m. – 2015m. ir 2020 m. – 2022m.

Tyrimo metodai: tyrimo metu buvo atlikta 2013 m. – 2015 m. ir 2020 m. – 2022 m. Lietuvos sveikatos mokslų universiteto Kauno klinikų (LSMU KK) ITS, CHS ir TS gydytų pacientų ėminių iš: žaizdų ir opų, kraujo, šlapimo bei kvėpavimo takų sekreto mikrobiologinės diagnostikos duomenų retrospektyvinė analizė. Buvo vertinti iš tiriamosios klinikinės medžiagos išaugę P. aeruginosa mikroorganizmai bei analizuotas jų atsparumas antibiotikams, pasirinktais periodais.

Rezultatai : tyrimo metu nustatyta, kad didžioji dalis, 2013 m. – 2015 m,. išaugintų P. aeruginosa mikroorganizmų buvo iš ITS gydomų pacientų klinikinės medžiagos (43.3 proc.), tačiau 2020 m. – 2022 m nustatytas reikšmingai didėjantis P. aeruginosa padermių išskyrimas iš CHS gydytų pacientų klinikinės medžiagos (46. 4 proc.). ITS profilio pacientams P. aeruginosa patikimai didesnė dalis buvo išskirta iš kvėpavimo takų sekreto (84.4 proc., P=0.000). TS profilio pacientams P. aeruginosa dažniau buvo išskirta iš kvėpavimo bei šlapimo takų ėminių, CHS – šlapimo takų bei žaizdų ir opų sekreto, tačiau reikšmingų skirtumų lyginant su kitomis klinikinėmis medžiagomis nustatyta nebuvo. 2020 m. – 2022 m. nustatytas atsparių P. aeruginosa padermių skaičius augimas. Gautas reikšmingai didėjantis (P=0.05) ceftazidimui (CAZ) atsparių padermių augimas, 2020 m. – 2022 m. Tyrimo nustatyta, kad daugiausia padermių buvo atsparios imipenemui (IMP) – 22.9 proc., meropenemui (MEM) – 21.2 proc., ciprofloksacinui (CIP) – 21.4 proc. Mažiausias atsparumas registruotas aminoglikozidų klasės atstovui- amikacinui (AMK) - 5.3 proc. Nagrinėjant P. aeruginosa padermių atsparumą pagal klinikinę medžiagą, nustatyta kad CEP ir CAZ atsparių padermių didžiausias augimo pokytis buvo registruotas padermėse išaugintose iš kvėpavimo takų ( 7 proc. didėjimas) bei žaizdų ir opų (13 proc. ir 11 proc. didėjimas); CIP – iš kraujo ėminių (13 proc. didėjimas); GEN – iš kraujo (12 proc. didėjimas) ir kvėpavimo takų sekreto (4 proc. didėjimas); MEM – iš kvėpavimo takų (12 proc. didėjimas), žaizdų ir opų ( 5 proc. didėjimas), TZP – kraujo ( 12 proc. didėjimas) bei žaizdų ir opų ( 8 proc. didėjimas) klinikinės medžiagos, analizuojant du nagrinėjamus laikotarpius.

Išvados:

1. Nustatytas reikšmingai didėjantis P. aeruginosa padermių išskyrimo dažnis CHS, analizuojant šešių metų tyrimo duomenis (P=0.001). ITS profilio pacientams P. aeruginosa patikimai dažniau buvo išskirta iš kvėpavimo takų (82.6 proc., P=0.000) lyginant su kitomis klinikinėmis medžiagomis.
2. Nustatytas reikšmingai didėjantis CAZ atsparių padermių augimas visų profilių klinikiniuose skyriuose (P=0.05). Lyginant du analizuojamus laikotarpius reikšmingas P. aeruginosa atsparumas kitų klasių antimikrobinėms medžiagoms nustatytas nebuvo.
3. Didžiausias iš kvėpavimo takų išaugintų atsparių P. aeruginosa padermių skaičiaus augimas buvo stebimas cefalosporinų, aminoglikozidų ir karbapenemų klasės antibiotikams; iš žaizdų ir opų – cefalosporinų ir karbapenemų klasės antibiotikams; iš kraujo ėminių – fluorochinolonų, aminoglikozidų ir penicilinų klasės antibiotikams.

Raktiniai žodžiai: P. aeruginosa, atsparumas antibiotikams, intensyvios terapijos skyrius, chirurgijos skyrius, terapijos skyrius, klinikinės medžiagos.

Author of Master Thesis: Greta Mikučionytė

Full title of Master Thesis: Dynamic of antimicrobial resistance pattern in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from different clinical specimens and hospital settings.

The goal: to evaluate the frequency and antimicrobial resistance patterns of P. aeruginosa strains isolaed from different hospital settings and clinical sources at the Lithuanian University of Health Sciences Kauno klinikos (LSMU KK).

The objectives:

1. To evaluate the dynamics of P. aeruginosa isolation frequency from different hospital settings and clinical sources in 2013 - 2015 and 2020 - 2022.
2. To evaluate the dynamics of antibiotic resistance patterns of P. aeruginosa strains isolated from Intensive care unit (ICU), Surgery unit (SU) and Pediatric unit (PU) in 2013 - 2015 and 2020 - 2022.
3. To evaluate the antibiotic resistance patterns of P. aeruginosa strains isolated from clinical sources in 2013 - 2015 and 2020 - 2022.

Test methods: the study was carried out by retrospectively examining microbiological samples of respiratory tract secretions, burn, wounds/ulcers, urinary and blood samples from patients who were treated in LSMU KC ICU, SU and PU during periods of 2013 - 2015 and 2020 - 2022. Microorganisms that colonised above mentioned clinical sources were identified and their antibiotic resistance was determined.

Results: during the study, it was determined that the majority of the P. aeruginosa microorganism was isolated from the ICU during the 2013 - 2015 period, respectively 43.3%. Meanwhile in 2020 – 2022, a significant increase in the isolation of P. aeruginosa strains from SU was determined (46.4%). There was a significant association between P. aeruginosa in respiratory samples from patients treated in the ICU (84.4 %, P=0.000). Patients whose were treated in PU was more often isolated with P. aeruginosa from respiratory and urinary tract samples, in CU - from urinary tract and wound and ulcer secretions, but no significant differences were found compared to other clinical specimens by two analyzed periods data. An increase in the percentage of resistant P. aeruginosa bacteria was observed in 2020 – 2022 compared to 2013- 2015. Significant increase in the growth of Ceftazidime-resistant strains (CAZ) in 2020- 2022, (P=0.05). In our study most of the strains were resistant to imipenem (IMP) - 22.9%, meropenem (MEM) - 21.2% and ciprofloxacin (CIP)- 21.4%. The lowest resistance was registered to amikacin (AMK) at - 5.3 percent. When investigating the resistance of P. aeruginosa strains based on clinical specimens it was determined that that the biggest differences in growth of CEP and CAZ was registered in strains grown from the respiratory tract (7% increase) and wounds/ulcers (13% and 11% increase), CIP – blood samples (13 % increase); GEN – blood (12 % increase) and respiratory tracts samples (4 % increase); MEM - respiratory tracts (12 % increase) and wounds/ulcers samples (5 % increase); TZP - blood (12 % increase) and wounds/ulcers samples (8% increase).

Conclusions:

1. A significant increase in the frequency of isolation of P. aeruginosa strains was found in SU analyzing the data of the six-year study (P=0.001). P. aeruginosa strains significantly more often isolated from the respiratory tract of ICU patients (82.6 proc., P=0.000), compared to other clinical specimens.
2. Significant increase in the growth of (CAZ) in 2020 - 2022, (P=0.05) was determined in this study, meanwhile no significant resistance of P. aeruginosa to other classes of antimicrobial substances was found, by comparing the two analyzed periods of data.
3. The biggest differences in the increase of P. aeruginosa strains isolated from the respiratory tract was observed of cephalosporin, aminoglycoside and carbapenem class of antibiotics; wounds and ulcers - for cephalosporins and carbapenem class antibiotics; blood samples - for fluoroquinolones, aminoglycosides and penicillin class antibiotics.

Key words: P. aeruginosa , resistance to antibiotics, Intensive care unit, Surgery Unit, Pediatric Unit, clinical specimens.