Genetic polymorphism study of Ixodes ricinus l. populations in Lithuania using RAPD markers

Abstract

Atlikti Lietuvoje labiausiai paplitusios erkės Ixodes ricinus pagrindinio infekcinių ligų, (erkinis encefalitas, Laimo liga, erlichiozė) pernešėjo genetinio kintamumo tyrimai, panaudojant atsitiktinai amplifikuotos polimorfinės DNR (AAPD) metodą . Erkės buvo surinktos skirtinguose Lietuvos rajonuose Vilniaus ir Biržų. Surinktų erkių taksonominė priklausomybė I. ricinus buvo nustatyta naudojant naujus specifinius pradmenis, sukurtus A. Jenkins. 47 I. ricinus DNR pavyzdžių polimorfizmas ištirtas AAPD metodu. Iš dešimties atsitiktinai susintetintų pradmenų, rasti penki produktyviausi, tinkami erkių I. ricinus populiacijų genetinės įvairovės tyrimams. AAPD analizės duomenys rodo, kad I. ricinus erkės surinktos Biržų ir Vilniaus rajonuose pasižymi didele genetine įvairove. Pagal gautus genetinės įvairovės duomenis buvo nustatyti genetiniai skirtumai tarp skirtingų Lietuvos I. ricinus erkių populiacijų. Ixodes ricinus ticks are common and widespread in Lithuania. They are the main vector in transmission of infectious diseases like tick-born encephalitis, Lyme borreliosis and human granulocytic ehrlichiosis. The aim of our study was to investigate genetic variability of I. ricinus ticks in Lithuania. I. ricinus ticks were collected from different locations of Lithuania. Data on genetic polymorphism of I. ricinus were used to determinate genetic distances within and among different Lithuanian populations in this species. At first, 103 collected ticks were analysed using specifics for I. ricinus new primers designed by A. Jenkins for taxonomic identification. PCR analysis data showed that all ticks were I. ricinus. Polymorphism of I. ricinus was analysed using the random amplified polymorphic DNA (RAPD) method. 47 DNA samples of I. ricinus ticks were used for RAPD reaction. Ten arbitrary sequence decamers were used as primers. Reproducible amplification patterns were obtained using five primers. RAPD analysis data showed that I. ricinus from Birþai and Vilnius were highly polymorphic. Similarities between RAPD patterns were used to evaluate genetic distances between I. ricinus populations in Lithuania.