Nekoduojančių YRNR molekulių raiška CNS navikais sergančiųjų kraujo serume
Baliūnaitė, Deimina |
Recenzentas / Reviewer |
Centrinės nervų sistemos (CNS) navikai – viena pavojingiausių vėžio formų, pasižyminti
dideliu sergamumu ir mirtingumu. Gliomos sudaro daugiau nei 80 % piktybinių CNS navikų, o
dažniausia iš jų – glioblastoma (GB). Žemo laipsnio gliomos (LGG) progresuoja lėčiau, tačiau gali
transformuotis į aukštesnio laipsnio navikus. Šiuolaikiniuose tyrimuose didelis dėmesys skiriamas naujų
biomarkerių, galinčių pagerinti CNS navikų diagnostiką ir gydymą, paieškai. Vieni perspektyviausių
biomarkerių - nekoduojančios Y-RNR molekulės, kurios yra aptinkamos ir kraujo serumo užląstelinėse
pūslelėse (UP).
Šio darbo tikslas buvo ištirti nekoduojančių Y-RNR molekulių raišką CNS navikais sergančiųjų
kraujo serume ir nustatyti galimas jų sąsajas su pacientų klinikinėmis charakteristikomis. Tyrime buvo
ištirti 28 pacientų, sergančių CNS navikais gliomomis, kraujo serumo mėginiai pavyzdžiai: 18 GB ir 10
LGG. Kraujo serume analizuota keturių, žmogaus organizme randamų, Y-RNR molekulių (Y1, Y3, Y4,
Y5) raiška, vertintos sąsajos su naviko tipu, pacientų klinikinėmis charakteristikomis (amžiumi, lytimi
ir išgyvenamumu). Tyrimo metu iš filtruoto kraujo serumo buvo grynintos UP, iš jų išskirtos RNR
molekulės, atlikta kDNR sintezė. Molekulių raiška analizuota naudojant AT TL-PGR. Statistiniai
skaičiavimai atlikti su GraphPad Prism 8.0.1 programa, taikant vidurkių palyginimui tarp grupių t-testą,
raiškos sąsajoms nustatyti taikytos Pearsono koreliacija bei išgyvenamumo analizei taikytas Kaplan
Mejerio metodas. Rezultatai buvo lyginami tarp grupių remiantis sumuota Y-RNR molekulių raiška,
atskirų RNY1, RNY3, RNY4 ir RNY5 molekulių raiškomis, Y-RNR raiškos santykiu. Gauti analizės
rezultatai parodė, kad lyginant patologines grupes pagal Y-RNR genų raiškos santykį statistiškai
reikšmingai tarp grupių skyrėsi Y3/Y4 (p=0,023), Y3/Y5 (p=0,004), o sumuota Y-RNR raiška ir atskirų
Y-RNR genų raiškos statistiškai reikšmingų skirtumų neparodė (p<0,05). Sąsajų su amžiumi nustatyta
nebuvo (p>0,05). Lyginant atskirų Y-RNR genų raiškas lyčių grupėse RNY1 geno raiška GB (p=0,028)
ir LGG (p=0,044) statistiškai skyrėsi, tuo tarpu sumuotos Y-RNR raiškos ir Y-RNR genų raiškos
santykio GB ir LGG statistiškai reikšmingų skirtumų nenustatyta (p>0,05). Išgyvenamumo analizė
parodė, kad gliomomis sergančiųjų išgyvenamumas statistiškai reikšmingai priklausė nuo Y1/Y5
(p=0,016) ir Y3/Y5 (p=0,011) genų santykio, o sumuota Y-RNR raiška ir atskirų Y-RNR raiškos
pokyčiai statistiškai reikšmingos priklausomybės neparodė (p>0,05).
Central nervous system (CNS) tumors are one of the most dangerous cancers with high
morbidity and mortality. Gliomas account for more than 80% of malignant CNS tumors, with
glioblastoma (GB) being the most common. Low grade gliomas (LGG) progresses more slowly, but can
transform into higher-grade tumors. In modern research, great attention is paid to the search for new
biomarkers that can improve the diagnosis and treatment of CNS tumors. Some of the most promising
biomarkers are non-coding Y-RNA molecules, which are also found in serum extracellular vesicles
(EV‘s).
The purpose of this work was to study the expression of non-coding Y-RNA molecules in the
blood serum of patients with CNS tumors and to identify their possible links with the clinical
characteristics of patients. Here we examined blood serum samples from 28 patients with CNS tumors
gliomas: 18 GB and 10 LGG. The expression of four Y-RNA molecules found in the human body (Y1,
Y3, Y4, Y5) was analyzed in serum, and association with tumor type and clinical characteristics (age,
sex, and survival) of patients was assessed. EVs were purified from filtered blood serum, RNA molecules
were isolated, and cDNA synthesis was performed. The expression of molecules was analyzed using
qRT-PCR. Statistical calculations were performed with GraphPad Prism 8.0.1, using the t-test for
comparison between groups, Pearson correlation for association, and Kaplan-Meier for survival
analysis. The results were compared based on the summed gene expression of Y-RNA molecules, the
expression of individual RNY1, RNY3, RNY4 and RNY5 genes, and Y-RNA gene ratio. The
results showed statistically significant difference between Y3/Y4 (p=0.023) and Y3/Y5 (p=0.004)
between the pathological groups (GB vs LGG), but no statistically significant difference comparing
combined Y-RNA and individual Y-RNA expression (p<0.05). No association with age was found
(p>0.05). When comparing individual Y-RNA expressions in the gender groups, the expression of the
RNY1 gene in GB (p=0.028) and LGG (p=0.044) differed, but no differences were found in summed Y
RNA expression and Y-RNA expression ratio in GB and LGG (p>0.05). In the survival analysis, there
was a statistically significant association with Y-RNA expression ratios Y1/Y5 (p=0.016) and Y3/Y5
(p=0.011) with glioma patient survival, and no statistically significant association between survival and
individual Y-RNA expression or summed Y-RNA expression (p>0.05).