Options
Apoptozėje dalyvaujančių TP53 ir BBC3 genų funkcinių polimorfizmų prognostinė vertė sergant ankstyvu krūties vėžiu
Recenzentas / Reviewer | |
Konsultantas / Consultant | |
Komisijos pirmininkas / Committee Chairman | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Tyrimo tikslas: Nustatyti apoptozėje dalyvaujančius funkcinius TP53 ir BBC3 genų polimorfizmus ir jų sąsajas su ankstyvo KV eiga. Tyrimo uždaviniai: 1. Įvertinti genų TP53 ir BBC3 polimorfizmų alelių ir genotipų pasiskirstymą tiriamosioms, sergančioms ankstyvu KV; 2. Išanalizuoti šių polimorfizmų sąsajas su klinikinėmis bei morfologinėmis naviko savybėmis; 3. Nustatyti šių polimorfizmų vertę, prognozuojant ankstyvu KV sergančių pacienčių išgyvenamumą. Tyrimo metodai: Įtraukta 171 ankstyvu (I–II stadijos) KV serganti pacientė. Genominė DNR buvo išskirta iš periferinio kraujo leukocitų. Polimerazės grandininės reakcijos (PGR) ir elektroforezės metodais buvo ištirti du funkciniai apoptozėje dalyvaujančių genų vieno nukleotido polimorfizmai (VNP): TP53 rs1042522 ir BBC3 rs2032809. Įvertintas alelių ir genotipų dažnių pasiskirstymas. Chi kvadrato ir regresinės analizės metodais įvertintos tirtų polimorfizmų sąsajos su žinomais KV prognostiniais veiksniais: pacienčių amžiumi diagnozės nustatymo metu (≤ 40 m./ > 40 m.), naviko dydžiu (≤ 2 cm/ > 2–5 cm), limfmazgių būkle (teigiami/ neigiami), estrogenų receptorių (ER) būkle (teigiama/ neigiama), progesterono receptorių (PR) būkle (teigiama/ neigiama), HER2 būkle (teigiama/ neigiama) bei naviko diferenciacijos laipsniu (G1+G2/ G3). Kaplan–Meiero išgyvenamumo analize bei Kokso regresijos modeliais įvertinta polimorfizmų įtaka laikui iki ligos atkryčio (LLA), laikui iki metastazavimo (LM) bei bendram išgyvenamumui (BI). Tyrimo rezultatai: Nustatytas polimorfizmų alelių ir genotipų dažnių pasiskirstymas: TP53 rs1042522 G alelis 77 %, C – 23 %, GG genotipas 59 %, CG – 35 %, CC – 6 %; BBC3 rs2032809 A alelis 53 %, G – 47 %, AG genotipas 48 %, AA – 29 %, GG – 23 %. Nustatyta, jog TP53 rs1042522 overdominantinis (CG) genotipas yra statistiškai reikšmingai susijęs su jaunesniu pacienčių amžiumi (p=0,03) ir didesniu pradiniu naviku (p=0,04), tačiau neturi įtakos pacienčių išgyvenamumui. BBC3 rs2032809 recesyvinis AA genotipas yra susijęs su vyresniu pacienčių amžiumi (p=0,042), o overdominantinis AG genotipas, lyginant su kitais genotipais, lėmė 5,11 kartų didesnę ligos atkryčio riziką (p < 0,0001), 4,80 kartų didesnę metastazių išsivystymo riziką (p=0,001) bei 8,24 karto didesnę mirties riziką (p=0,001). Išvados: Tyrimo metu BBC3 geno rs2032809 polimorfizmo genotipas AG buvo dažniausias, o rečiausias GG. Tiriant TP53 geno rs1042522 polimorfizmą, dažniausias genotipas buvo GG, rečiausias – CC. Remiantis šio tyrimo rezultatais, TP53 rs1042522 funkcinis polimorfizmas yra susijęs su krūties vėžio išsivystymu ankstesniame amžiuje ir didesniu pirminio naviko dydžiu, o BBC3 rs2032809 polimorfizmas yra siejamas su krūties vėžio išsivystymu vyresniame amžiuje. BBC3 rs2032809 polimorfizmas yra nepriklausomas blogos KV prognozės veiksnys, lemiantis ankstyvesnį ligos atkirtį, metastazavimą bei trumpesnį ankstyvu KV sergančių pacienčių išgyvenamumą.
Aim of the study: To estimate apoptosis-related gene TP53 and BBC3 functional polymorphisms and their associations with prognosis of early-stage breast cancer (BC). Research objectives: 1. To evaluate allele and genotype distributions of TP53 and BBC3 gene polymorphisms in subjects with early-stage BC; 2. To analyse the associations of these polymorphisms with clinical and morphological characteristics of the tumour; 3. To determine the prognostic value of these polymorphisms for survival outcomes in early-stage BC. Methods: 171 patients with early-stage (stage I-II) BC were enrolled. Genomic DNA was isolated from peripheral blood leukocytes. Two functional single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of the apoptosis-related genes have been analysed using polymerase chain reaction (PCR) and electrophoresis: TP53 rs1042522 and BBC3 rs2032809. Frequency distribution of the alleles and genotypes was evaluated. Chi-square and regression analyses were used to evaluate the associations between the investigated polymorphisms and known BC prognostic factors: patient age at diagnosis (≤ 40 years/> 40 years), tumour size (≤ 2 cm / >2–5 cm), lymph node status (positive/ negative), estrogen receptor (ER) status (positive/ negative), progesterone receptor (PR) status (positive/ negative), HER2 status (positive/ negative) and tumour differentiation grade (G1 + G2/ G3). Kaplan-Meier's survival analysis and Cox regression models were used to evaluate the impact of analysed polymorphisms on recurrence-free survival, metastasis-free survival, and overall survival. Study results: Frequency distribution of alleles and genotypes: TP53 rs1042522 G allele 77%, C 23%, GG genotype 59%, CG 35%, CC 6%; BBC3 rs2032809 A allele 53%, G 47%, AG genotype 48%, AA 29%, GG 23%. The TP53 rs1042522 overdominant (CG) genotype was statistically significantly associated with younger patient age at diagnosis (p = 0.03) and larger tumour size at the baseline (p = 0.04) but did not influence patient survival. The recessive AA genotype of BBC3 rs2032809 is associated with older patient age (p = 0.042), and the overdominant AG genotype resulted in a 5.11 times higher risk for relapse (p <0.0001), a 4.80 times higher risk for developing metastases (p = 0.001) and 8.24 times higher risk for death (p = 0.001). Conclusions: In the study, the genotype AG of the rs2032809 BBC3 gene was the most common meanwhile the rarest was GG genotype. In the TP53 gene rs1042522 polymorphism, the most frequent genotype was GG and the rarest was CC. According to the results of this study, TP53 rs1042522 functional polymorphism is associated with earlier breast cancer development and larger tumour size, whereas BBC3 rs2032809 polymorphism is associated with older age of disease onset. The BBC3 rs2032809 polymorphism was an independent prognostic factor for recurrence-free survival, metastasis-free survival and overall survival in early-stage BC.